Catalogo dei Corsi di studio

Il corso ha l'obiettivo di fornire agli studenti una formazione pratica e teorica sui più comuni modelli e strumenti di analisi dei dati "omici" in biologia e medicina molecolare. L'attesa è che dopo aver completato il corso lo studente sia in grado di analizzare ed interpretare dati su larga scala come , per esempio, i dati di trascrittomica di un paziente utilizzando una metodologia appropriata implementata con matlab. Inoltre, lo studente sarà in grado di capire la teoria biologica alla base delle tecniche di analisi e di analizzarne criticamente i risultati.

Programma

Introduzione alla bioinformatica
Introduzione alla biologia
Banche dati biologiche
UCSC Genome Browser e Table Browser
Richiami di Statistica descrittiva
Test di ipotesi e test ipergeometrico
Arricchimenti di una lista di geni
Introduzione ad R e Rstudio
Biomart con R
Introduzione al TCGA
Introduzione all'NGS
Elementi di teoria delle reti
Reti di correlazione genica

Testi adottati

slide fornite a lezione

Bibliografia di riferimento

letteratura di riferimento fornita a lezione

Prerequisiti

Conoscenza di informatica di base.

Modalità di svolgimento

La didattica viene svolta in presenza e settimanalmente ci sono oltre alle lezioni teoriche anche delle lezioni pratiche di esercitazione in aula con i propri computer.

Modalità di frequenza

Facoltativa

Modalità di valutazione

Lo studente dovra' consegnare un progetto concordato con il docente.
L'esame finale riguardera' la discussione orale del progetto scelto.
La valutazione finale riflettera' sia il giudizio sul lavoro svolto a casa riguardante i compiti assegnati durante il corso,
sia un giudizio sulle capacita' dello studente di ragionamento, di sintesi e di lavoro autonomo.

Data inizio prenotazione	Data fine prenotazione	Data appello
02/02/2023	08/02/2023	09/02/2023
09/03/2023	15/03/2023	16/03/2023
30/05/2023	05/06/2023	06/06/2023
29/06/2023	05/07/2023	06/07/2023
31/08/2023	06/09/2023	07/09/2023
12/10/2023	18/10/2023	19/10/2023
13/09/2023	06/01/2024	11/01/2024