MOLECULAR BIOLOGY OF STEM CELLS

Obiettivi formativi

Il corso si propone di fornire conoscenze sulle proprietà fondamentali delle cellule staminali, con particolare attenzione ai meccanismi molecolari che ne regolano le capacità di autorinnovamento e differenziamento. Il corso intende inoltre chiarire le potenzialità della riprogrammazione di cellule somatiche in cellule staminali pluripotenti indotte (iPS), fornendo nozioni sui meccanismi epigenetici alla base del processo di riprogrammazione. Verranno forniti esempi dell’utilizzo delle cellule staminali per la creazione di sistemi modello in vitro di diverse patologie umane e in medicina rigenerativa. Lo studente è guidato lungo il percorso perché arrivi alla comprensione dei processi che determinano le peculiari capacità delle cellule staminali di dare origine ai diversi tipi cellulari differenziati che compongono gli organi e i tessuti. Non sono previste attività di laboratorio. Conoscenza e comprensione Lo studente: - Conosce correttamente la terminologia relativa alle cellule staminali; - Conosce le basi molecolari dei processi biologici che regolano l’autorinnovamento e differenziamento delle cellule staminali; - Conosce i diversi livelli di regolazione epigenetica del differenziamento delle cellule staminali; -Conosce le tecniche di base per lo studio delle celle staminali Capacità di applicare conoscenza e comprensione Lo studente: - sa utilizzare correttamente la terminologia relativa alle cellule staminali - sa distinguere i diversi tipi di cellule staminali, anche in base al potenziale differenziativo - sa valutare il possibile utilizzo delle cellule staminali come sistemi modello in biologia; - sa valutare il possibile utilizzo delle cellule staminali in campo applicativo - è in grado di utilizzare le conoscenze sulle tecniche per lo studio delle cellule staminali per programmare un esperimento in laboratorio.

Canale 1
ALESSANDRO ROSA Scheda docente

Programmi - Frequenza - Esami

Programma
1) Introduzione e contesto (8 ore) - Cellule staminali adulte ed embrionali; potenziale differenziativo; nicchia staminale; esempi di cellule staminali adulte; epigenetica. - Tecniche di biologia molecolare per lo studio delle cellule staminali. 2) Basi molecolari di pluripotenza (20 ore) - Origine delle cellule staminali embrionali; circuiti regolativi nella formazione della blastocisti di mammifero. - Regolazione della pluripotenza: vie di segnalazione, stati "naive" e "primed" di pluripotenza, circuiti regolativi trascrizionali e post-trascrizionali, controllo epigenetico della pluripotenza, regolazione da parte di microRNA e lncRNA. - Basi molecolari del differenziamento delle cellule staminali pluripotenti; esempi di differenziamento per generare tipi di cellule per terapia e ricerca; strategie per migliorare l'efficienza del differenziamento. - Cellule staminali pluripotenti nella ricerca di base e nella medicina rigenerativa. 3) riprogrammazione cellulare e transdifferenziamento (20 ore) - Dal trasferimento nucleare alle cellule iPS; - Meccanismi molecolari di riprogrammazione; modelli deterministici e stocastici; fasi iniziali, intermedie e tardive nella riprogrammazione; memoria epigenetica. - cellule iPS paziente-specifiche paziente; applicazioni di riprogrammazione nella ricerca di base e nella medicina rigenerativa; tecniche di "genome editing" per correggere le mutazioni; generazione di organoidi in vitro. - Transdifferenziamento: metodi e applicazioni; basi epigenetiche del transdifferenziamento; esempi di transdifferenziamento per ottenere cellule di interesse terapeutico (muscoli, neuroni).
Prerequisiti
Non sono previste propedeuticità. Lo studente deve tuttavia avere nozioni di base della biologia cellulare e molecolare.
Testi di riferimento
Articoli scientifici di riferimento e altro materiale didattico verranno indicati a lezione. Il docente metterà anche a disposizione le presentazioni powerpoint delle lezioni sulla piattaforma Elearning di Sapienza.
Modalità insegnamento
Il corso si svolge attraverso una serie di lezioni frontali e seminariali.
Frequenza
La frequenza è facoltativa ma fortemente raccomandata
Modalità di esame
Modalità di valutazione: unica prova orale da svolgersi dopo il termine dell'insegnamento. L'obiettivo della prova è la verifica delle conoscenze acquisite, coerentemente con gli obiettivi formativi. Le domande saranno aperte e con risposta aperta. La durata della prova orale sarà all'incirca di 30 minuti. I seguenti elementi verranno presi in esame ai fini della valutazione: acquisizione delle conoscenze e capacità di ragionamento autonomo. Tali aspetti concorrono in egual misura alla formulazione del giudizio finale.
Bibliografia
Ramalho-Santos, M. & Willenbring, H. (2007). On the origin of the term “stem cell.” Cell Stem Cell, 1, 35–38. Dröscher, A. (2014). Images of cell trees, cell lines, and cell fates: the legacy of Ernst Haeckel and August Weismann in stem cell research. HPLS, 36, 157–186. https://doi.org/10.1007/s40656-014-0028-8 Hsu, Y.-C. & Fuchs, E. (2012). A family business: stem cell progeny join the niche to regulate homeostasis. Nat Rev Mol Cell Biol, 13, 103–114. Zernicka-Goetz, M., Morris, S. A. & Bruce, A. W. (2009). Making a firm decision: multifaceted regulation of cell fate in the early mouse embryo. Nat Rev Genet, 10, 467–477. Evans, M. (2011). Discovering pluripotency: 30 years of mouse embryonic stem cells. Nat Rev Mol Cell Biol, 12, 680–686. Bermejo-Alvarez, P., Ramos-Ibeas, P. & Gutierrez-Adan, A. (2012). Solving the ‘x’ in embryos and stem cells. Stem Cells Dev, 21, 1215–1224. Jaenisch, R. & Young, R. (2008). Stem cells, the molecular circuitry of pluripotency and nuclear reprogramming. Cell, 132, 567–582. Gonzales, K. A. U. & Ng, H.-H. (2011). Choreographing pluripotency and cell fate with transcription factors. Biochim Biophys Acta, 1809, 337–349. Boyer, L. A. et al. (2005). Core transcriptional regulatory circuitry in human embryonic stem cells. Cell, 122, 947–956. Cole, M. F., Johnstone, S. E., Newman, J. J., Kagey, M. H. & Young, R. A. (2008). Tcf3 is an integral component of the core regulatory circuitry of embryonic stem cells. Genes Dev, 22, 746–755. Whyte, W. A., Orlando, D. A., Hnisz, D., Abraham, B. J., Lin, C. Y., Kagey, M. H., Rahl, P. B., Lee, T. I. & Young, R. A. (2013). Master transcription factors and mediator establish super-enhancers at key cell identity genes. Cell, 153, 307–319. Spivakov, M. & Fisher, A. G. (2007). Epigenetic signatures of stem-cell identity. Nat Rev Genet, 8, 263–271. Mattout, A. & Meshorer, E. (2010). Chromatin plasticity and genome organization in pluripotent embryonic stem cells. Curr Opin Cell Biol, 22, 334–341. Jones, A. & Wang, H. (2010). Polycomb repressive complex 2 in embryonic stem cells: an overview. Protein Cell, 1, 1056–1062. Gaspar-Maia, A., Alajem, A., Meshorer, E. & Ramalho-Santos, M. (2011). Open chromatin in pluripotency and reprogramming. Nat Rev Mol Cell Biol, 12, 36–47. Li, M., Liu, G.-H. & Izpisúa Belmonte, J. C. (2012). Navigating the epigenetic landscape of pluripotent stem cells. Nat Rev Mol Cell Biol, 13, 524–535. Young, R. A. (2011). Control of the embryonic stem cell state. Cell, 144, 940–954. Voigt, P. et al. (2013). A double take on bivalent promoters. Genes Dev, 27, 1318–1338. White, J. & Dalton, S. (2005). Cell cycle control of embryonic stem cells. Stem Cell Reviews, 1, 131–138. Conklin, J. F. & Sage, J. (2009). Keeping an eye on retinoblastoma control of human embryonic stem cells. J Cell Biochem, 108, 1023–1030. Rosa, A. & Brivanlou, A. H. (2009). microRNAs in early vertebrate development. Cell Cycle, 8. Wang, Y. & Blelloch, R. (2009). Cell cycle regulation by microRNAs in embryonic stem cells. Cancer Res, 69, 4093–4096. Rosa, A. & Brivanlou, A. H. (2013). Regulatory non-coding RNAs in pluripotent stem cells. Int J Mol Sci, 14, 14346–14373. Rosa, A. & Ballarino, M. (2016). Long noncoding RNA regulation of pluripotency. Stem Cells Int, 2016:1797692. Fatica, A. & Bozzoni, I. (2014). Long non-coding RNAs: new players in cell differentiation and development. Nat Rev Genet, 15, 7–21. Karus, M., Blaess, S. & Brüstle, O. (2014). Self-organization of neural tissue architectures from pluripotent stem cells. J Comp Neurol, 522, 2831–2844. Gurdon, J. B. & Melton, D. A. (2008). Nuclear reprogramming in cells. Science, 322, 1811–1815. Gurdon, J. (2009). Nuclear reprogramming in eggs. Nature Medicine. doi:10.1038/nm1009-1141. Gurdon, J. B. & Byrne, J. A. (2004). The first half-century of nuclear transplantation. Biosci Rep, 24, 545–557. Yamanaka, S. (2008). Pluripotency and nuclear reprogramming. Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci, 363, 2079–2087. Graf, T. (2011). Historical origins of transdifferentiation and reprogramming. Cell Stem Cell, 9, 504–516. Takahashi, K. & Yamanaka, S. (2006). Induction of pluripotent stem cells from mouse embryonic and adult fibroblast cultures by defined factors. Cell, 126, 663–676. Martello, G. & Smith, A. (2014). The nature of embryonic stem cells. Annu Rev Cell Dev Biol, 30, 647–675. Ohtsuka, S. & Dalton, S. (2008). Molecular and biological properties of pluripotent embryonic stem cells. Gene Ther, 15, 74–81. Pera, M. F. & Tam, P. P. L. (2010). Extrinsic regulation of pluripotent stem cells. Nature, 465, 713–720. Dreesen, O. & Brivanlou, A. H. (2007). Signaling pathways in cancer and embryonic stem cells. Stem Cell Reviews, 3, 7–17. Nichols, J. & Smith, A. (2009). Naive and primed pluripotent states. Cell Stem Cell, 4, 487–492. Yamanaka, S. (2007). Strategies and new developments in the generation of patient-specific pluripotent stem cells. Cell Stem Cell, 1, 39–49. Zhao, R. & Daley, G. Q. (2008). From fibroblasts to iPS cells: induced pluripotency by defined factors. J Cell Biochem, 105, 949–956. Wernig, M. et al. (2007). In vitro reprogramming of fibroblasts into a pluripotent nES-cell-like state. Nature, 448, 318–324. Vierbuchen, T. & Wernig, M. (2012). Molecular roadblocks for cellular reprogramming. Mol Cell, 47, 827–838. Papp, B. & Plath, K. (2011). Reprogramming to pluripotency: stepwise resetting of the epigenetic landscape. Cell Res, 21, 486–501. Stadtfeld, M. & Hochedlinger, K. (2010). Induced pluripotency: history, mechanisms, and applications. Genes Dev, 24, 2239–2263. Buganim, Y., Faddah, D. A. & Jaenisch, R. (2013). Mechanisms and models of somatic cell reprogramming. Nat Rev Genet, 14, 427–439. Sancho-Martinez, I. & Izpisúa Belmonte, J. C. (2013). Stem cells: Surf the waves of reprogramming. Nature, 493, 310–311. Silva, J., Nichols, J., Theunissen, T. W., Guo, G., van Oosten, A. L., Barrandon, O., Wray, J., Yamanaka, S., Chambers, I. & Smith, A. (2009). Nanog is the gateway to the pluripotent ground state. Cell, 138, 722–737. Kiskinis, E. & Eggan, K. (2010). Progress toward the clinical application of patient-specific pluripotent stem cells. J Clin Invest, 120, 51–59. Pera, M. F. (2011). Stem cells: The dark side of induced pluripotency. Nature, 471, 46–47. Drews, K., Jozefczuk, J., Prigione, A. & Adjaye, J. (2012). Human induced pluripotent stem cells—from mechanisms to clinical applications. J Mol Med, 90, 735–745. Sandoe, J. & Eggan, K. (2013). Opportunities and challenges of pluripotent stem cell neurodegenerative disease models. Nat Neurosci, 16(7), 780–789. Bilic, J. & Izpisúa Belmonte, J. C. (2012). Concise review: Induced pluripotent stem cells versus embryonic stem cells: close enough or yet too far apart? Stem Cells, 30, 33–41. Rowe, R. G. & Daley, G. Q. (2019). Induced pluripotent stem cells in disease modelling and drug discovery. Nat Rev Genet, 20, 377–388. Vierbuchen, T. & Wernig, M. (2011). Direct lineage conversions: unnatural but useful? Nat Biotechnol, 29, 892–907.
Modalità di erogazione
Il corso si svolge attraverso una serie di lezioni frontali e seminariali.
  • Codice insegnamento1051863
  • Anno accademico2025/2026
  • CorsoGenetica e Biologia Molecolare - Genetics and Molecular Biology
  • CurriculumGenetics and Molecular Biology (percorso valido anche ai fini del conseguimento del doppio titolo italo-francese) - in lingua inglese
  • Anno1º anno
  • Semestre2º semestre
  • SSDBIO/11
  • CFU6